新成立的创新工程学院（FIE）是通过重组信息科技、纳米技术与材料科学、系统与控制、环境科学与工程的现有优势而组建的。创新工程学院下设计算机科学与工程学院、工程科学系、材料科学与工程系和环境科学与工程系。 FIE 还具有促进与两个国家重点实验室（中医药和空间科学）和医学院合作的组织架构。为了紧贴现代工程学科快速发展和学科多样化的步伐，澳科大的课程强调通过严谨的核心基础课程和深入的跨学科个性化创新项目来培育“创新”和跨学科思维。此外，学生还能接触到更为宽广的知识库，包括沟通交流、创业精神和设计思维。

　　澳科大汇聚英才，提供独具特色的创新工程课程。在澳门这样一座拥有 400 多年东西方文化底蕴的世界性城市中，澳科大创新工程学院的优秀学子、教师和其他工作人员在创新性的本科和研究生课程中和谐相处，营造出一个从事理工科研究造福人类的绝佳场所。欢迎您浏览我们的学院网站，了解更多相关信息

在2000年创立的资讯科技学院，是大学最早的四个学院之一，为发展优势学科，重新规划工科体系，澳门科技大学于2022年3月将建校之初成立的「资讯科技学院」整合为「创新工程学院」。作为一所跨学科的学院，创新工程学院汇集了来自不同领域的专业教师团队，为学生提供全面的工程学习和实践。学院开设了计算机科学与工程学院、工程科学系、材料科学与工程系、环境科学与工程系以及太空科学与技术系，涵盖多个领域，如电子工程、计算机科学、材料工程、环境科学、太空科技等，以满足不同学生的学习需求和职业发展目标。通过提供优质的教育资源和培养跨学科能力，创新工程学院为学生的学术发展和职业成功打下坚实的基础。

  澳科大计算机科学在「科睿唯安」2021年「基本科学指标资料库」统计数据中跻身全球前1%；在泰晤士高等教育「2024年世界大学学科排行榜」中位列世界176-200 区间；在上海软科「2023软科世界一流学科排名」中位列世界101-150区间，澳科大控制科学与工程位列此榜单的世界51-75区间。在U.S. News 发布的2024年世界大学学科排行榜中，澳科大人工智能专业，位列世界第93位。