在2000年创立的资讯科技学院，是大学最早的四个学院之一，为发展优势学科，重新规划工科体系，澳门科技大学于2022年3月将建校之初成立的「资讯科技学院」整合为「创新工程学院」。作为一所跨学科的学院，创新工程学院汇集了来自不同领域的专业教师团队，为学生提供全面的工程学习和实践。学院开设了计算机科学与工程学院、工程科学系、材料科学与工程系、环境科学与工程系以及太空科学与技术系，涵盖多个领域，如电子工程、计算机科学、材料工程、环境科学、太空科技等，以满足不同学生的学习需求和职业发展目标。通过提供优质的教育资源和培养跨学科能力，创新工程学院为学生的学术发展和职业成功打下坚实的基础。

  澳科大计算机科学在「科睿唯安」2021年「基本科学指标资料库」统计数据中跻身全球前1%；在泰晤士高等教育「2024年世界大学学科排行榜」中位列世界176-200 区间；在上海软科「2023软科世界一流学科排名」中位列世界101-150区间，澳科大控制科学与工程位列此榜单的世界51-75区间。在U.S. News 发布的2024年世界大学学科排行榜中，澳科大人工智能专业，位列世界第93位。