新成立的創新工程學院（FIE）是通過重組信息科技、納米技術與材料科學、系統與控制、環境科學與工程的現有優勢而組建的。創新工程學院下設計算機科學與工程學院、工程科學系、材料科學與工程系和環境科學與工程系。 FIE 還具有促進與兩個國家重點實驗室（中醫藥和空間科學）和醫學院合作的組織架構。為了緊貼現代工程學科快速發展和學科多樣化的步伐，澳科大的課程強調通過嚴謹的核心基礎課程和深入的跨學科個性化創新項目來培育“創新”和跨學科思維。此外，學生還能接觸到更為寬廣的知識庫，包括溝通交流、創業精神和設計思維。

澳科大匯聚英才，提供獨具特色的創新工程課程。在澳門這樣一座擁有 400 多年東西方文化底蘊的世界性城市中，澳科大創新工程學院的優秀學子、教師和其他工作人員在創新性的本科和研究生課程中和諧相處，營造出一個從事理工科研究造福人類的絕佳場所。歡迎您瀏覽我們的學院網站，了解更多相關信息！

創新工程學院是在大學領導層深思熟慮，與持份者充分磋商，對全球大學和研究機構類似舉措認真研究，以及參考了來自科技界翹楚的積極反饋而做出的重大決定。澳門科技大學創新工程學院於2022年3月27日正式成立。

創新工程學院把具實力但分散的重點研究方向集中到統一的結構和組織中，從而鞏固了工程學科間的協作而提升了資源的效用，為跨學科的創建、發展、和開花結果提供肥沃的土壤，且為大學國際化集中了力度。

創新工程學院的初步組織和結構將包含以下學術單位：計算機科學與工程學院、工程科學系、材料科學與工程系以及環境科學與工程系。創新工程學院中各院系將成為以下相應研究機構依附的教學單位：澳門系統工程研究所、澳門環境研究院、澳門材料科學與工程研究院、澳門智慧城市研究院、下一代互聯網國際研究院、開放智能電動車研究中心、智能機器人技術創新中心以及澳門數學研究中心。這個結構更促進了與校內其他單位的跨部門合作，包括醫學院，中藥質量研究國家重點實驗室，埃爾文內爾博士生物物理與創新藥物實驗室，月球與行星科學國家重點實驗室，澳門海岸帶生態環境國家野外科學觀測研究站和水利部數字孿生流域重點實驗室。